Desde su llegada a la Liga MX, los Cañoneros del Mazatlán estuvieron en el ojo de la polémica. Desde su cita con la desaparición de Monarcas Morelia del Máximo Circuito del fútbol mexicano, la afición en general no aprobó su permanencia, llamándolos "El Morelia Morado". La Perla del Pacífico no se caracteriza por ser una plaza de fútbol donde la construcción del Estadio El Encanto (antes Karaken) también generó polémica una vez que se ha especulado que existieron recursos del erario público para su construcción.
Luego de 6 años en la Liga MX, donde disputaron 12 torneos, los Cañoneros del Mazatlán se despiden del fútbol de “primera división” donde en este lapso no llegaron a la fase de Liguilla, solo estuvieron en Play-In un par de veces, pero quedaron eliminados desde el primer juego. Bajo las transmisiones de TV Azteca, empresa propietaria del equipo morado hasta su venta a finales de 2025, produjo un video de despedida para las redes sociales del equipo donde resaltan que se trata de un equipo "extranjero".
El debut de Mazatlán en la Liga MX fue en el torneo Apertura (Guardianes) 2020 en plena pandemia de COVID-19. No fue un momento alentador, pero marcó un presagio tormentoso para un equipo creado en los laboratorios de TV Azteca y avalado por la Federación Mexicana de Futbol. Su inicio no fue bien visto, pero su salida ha sido celebrada por todos los aficionados al fútbol azteca. En un sexenio de vida, los Cañoneros disputaron 206 partidos donde solo lograron 48 victorias, 57 empates y 101 derrotas.
Su cuota goleadora acabó en números negativos con un saldo de 237 goles a favor y 345 en contra, es decir una diferencia de goles de -108. En el camino, recibieron 3 multas económicas por la tabla de cocientes. Su mejor posición fue el puesto 10 y 12 que les permitió llegar a la fase Play-In pero fueron despachados por Atlas y Pachuca. Sus jugadores con mayor atención mediática fueron Nicolás Benedetti (por su pasado con el América) y Rodolfo Pizarro, (pasado con Chivas). Aunque en el torneo pasado destacaron Josué Ovalle (5 goles en 11 partidos) y Brian Rubio (4 goles en 14 partidos).
Con la compra de la franquicia Cañoneros de Mazatlán por parte del empresario Emilio Escalante, dueño de los Potros de Hierro del Atlante, la plaza de Mazatlán se mantiene en la Liga de Expansión. Sin embargo, queda la duda de si la franquicia "Cañoneros" se mantendrá o será transferida a otro equipo. Se ha mencionado que la directiva de "Dorados de Sinaloa" no desea jugar más en Culiacán debido al tema de violencia e inseguridad que prevalece en la región.
Ante este escenario, es posible que para el torneo Apertura 2026, el próximo equipo que juegue en el Estadio El Encanto sean los “Dorados de Mazatlán” con su uniforme blanco, azul y oro, o los “Cañoneros de Sinaloa” con el tradicional uniforme morado. El fútbol y el estado de Sinaloa han escrito varios episodios en su corta historia. Sin embargo, estos han tenido que ser interrumpidos debido al narcotráfico y la inseguridad que continúa en la región, donde el gobernador de la entidad, Rubén Rocha Moya, está en la mira de las autoridades de justicia de Estados Unidos.
